В названиях семинарий и академий с прописной буквы пишется только первое слово, исключая имена собственные:

• Московская православная духовная академия,
• Киевская православная духовная академия,
• Санкт-Петербургская православная духовная академия,
• Общецерковная аспирантура и докторантура имени святых равноапостольных Кирилла и Мефодия,
• московская Сретенская духовная семинария,
• Церковно-научный центр «Православная энциклопедия».

В определениях, образованных от слова святой и собственного имени святого, каждая часть прилагательного пишется с прописной буквы: Православный Свято-Тихоновский гуманитарный университет.

Примечание. Прилагательное «духовная» в названиях православных академий и семинарий является определением XIX в., указывающим на то, что в данных учебных заведениях учились дети духовного сословия, т. е. духовенства, клира. По этой причине по правилам современной орфографии в названиях академий и семинарий это слово пишется со строчной буквы.

Названия кафедр духовных учебных заведений, структурных подразделений синодальных отделов, учреждений и организаций пишутся со строчной, кроме имен собственных:

• кафедра патрологии,
• кафедра библеистики,
• кафедра истории Священного Писания,
• кафедра сравнительного богословия,
• кафедра догматического богословия,
• кафедра истории Русской Православной Церкви;
• библиографический отдел Церковно-научного центра «Православная энциклопедия»;
• отдел богослужебных книг Издательства Московской Патриархии;
• отдел научно-богословских изданий Издательства Московской Патриархии;
• секретариат научно-богословского рецензирования и экспертной оценки Издательского совета Русской Православной Церкви;
• информационный секретариат Издательского совета Русской Православной Церкви.

Неполные названия духовных учебных заведений, заменяющие полное, традиционно пишутся с прописной: Московская православная духовная академия – Академия.

Все слова в наименованиях средних учебных заведений, кроме имен собственных и образованных от них определений, пишутся со строчной буквы:

• московская регентско-певческая семинария при соборе Богоявления бывшего Богоявленского монастыря,
• православная гимназия в Ясенево,
• православная классическая гимназия при Греко-латинском кабинете Ю. А. Шичалина.

 В наименованиях структурных подразделений обучающего характера со строчной буквы пишутся все слова, кроме имен собственных и первого слова в условном обозначении в кавычках:

• курсы патронажных и требных сестер при храме вмч. и целителя Пантелеимона,
• заочная воскресная школа для заключенных при храме прп. Серафима Саровского в Раеве.

Церковные учреждения культуры, в том числе включающие в себя условные обозначения в кавычках

В названиях церковных учреждений культуры со строчной пишутся все слова, кроме имен собственных:

• православный театр «Глас»,
• дом православной культуры «Звезда Вифлеема»,
• православная библиотека при храме Рождества Иоанна Предтечи.

В названиях духовно-просветительских центров все слова, кроме собственных имен и условных обозначений в кавычках, пишутся со строчной буквы:

• православная библиотека при храме Благовещения Пресвятой Богородицы в Петровском парке,
• библиотека духовной литературы при храме Спаса Преображения на Песках,

но: Патриарший центр духовного развития детей и молодежи при Даниловском ставропигиальном мужском монастыре.

Источник: Редакционно-издательское оформление церковных печатных изданий: справочник автора и издателя. М: Издательство Московской Патриархии, 2015.